青贮发酵的过程可分为三个阶段：阶段是好气菌的活动，植物原料装入窖内继续呼吸、消耗青贮料间隙中的氧，产生二氧化碳和水，释放能量或热量。同时好气的酵母菌与霉菌大量生长和繁殖。从原料装入到原料停止呼吸，变为嫌气状态，这段时间要求越短越好，可以迅速地减少霉菌和其他******对饲料的作用。第二阶段是——主要是乳酸菌与分解蛋白质的***以异常快的速度繁殖，同时霉菌和酵母，饲料中乳酸增加，pH下降到4.2以下。第三阶段是当酸度达到一定程度，青贮窖内的蛋白质分解菌和乳酸菌本身也被，青贮料的调制过程完成，各种变化基本处于一个相对稳定的环境状态，使饲料可以长时间的保存。

青贮60天后，待饲料发酵成熟，乳酸菌达到一定的数量时具备抗******和霉菌的能力后才可开窖饲喂。青贮质量好的青贮饲料，应有苹果酸味或酒精酸味，颜色为暗绿色，表面无黏液，pH在4以下。开窖后青贮料饲喂要注意以下几点：一是发现有霉变的饲料要扔掉；二是开窖的面积不宜过多，防止暴露面积大，好氧的***在外面的饲料变质；三是取用时不要松动深层的饲料，以防空气进入；四是饲喂量要由少到多，使羊渐渐适应。在生产中，有的农民不了解青贮原理和使用要点，见饲料的表面有点发霉，怕饲料变质坏掉，就赶快把青贮窖上的塑料薄膜去掉并翻动，结果青贮饲料很快腐烂变质，造成了不应有的损失。

青贮设施的准备。青贮饲料常用的设施有青贮塔、青贮窖、青贮壕、青贮池、青贮袋等。如果是制作青贮饲料，可根据实际情况和条件进行设施的准备；如果已多次制作青贮饲料，要对现有青贮设施进行清洗、消毒或维修，以备使用。青贮原料的收割。青贮原料要适时收割，这样既可保证营养和含水量适宜，又可保证单位面积的产量。收割时间宜早不宜迟，一般禾本科牧草在孕穗至抽穗期收割，豆科牧草在孕蕾至初花期收割，随割随贮。调制半干青贮饲料时，刈割后的牧草先在草地上晾晒半天，然后集成堆再晾晒1～1.5天，使禾本科牧草含水量降到45%，豆科牧草含水量降低到50%，然后再进行运输、切碎、装贮。

尽管单独加入酶或菌时都可以降解并转化秸秆中的纤维素成分，从而提高秸秆的利用价值，但都存在或多或少的不足，如果利用酶和菌之间的互相作用协同处理秸秆则能够取得更佳的效果。陈合等（2008）采用黄孢原毛平革菌结合外源纤维素酶和木聚糖酶共同降解玉米秸秆，显著提高了其还原糖含量。李新社等（2011） 已利用纤维素酶和康宁木霉菌共处理玉米秸秆将其转化为可发酵糖，并从玉米秸秆降解物中获得了4.852g/L 的还原糖。菌酶共降解工艺为利用秸秆提供了一种新的研究方法，现已立足于玉米秸秆的生物发酵领域并成为其中的一个研究热点。