有机产品在生产和流通过程中，有完善的跟踪体系和完整的生产和销售记录；必须通过合法的，***的第三方公正性的有机产品认证机构的认证。 申请有机产品认证应具有合法的经营资质，如营业执照、生产许可证；合法的土地使用证明，如土地租赁协议、产权证等。 目前我国有机产品主要包括粮食、蔬菜、水果、奶制品、饮料、酒、畜禽产品、水产品及调料等。有机产品还包括棉、麻、竹、服装、饲料（有机标准包括动物饲料）等“非食品”。

每一个申请有机认证的产品，每生产一次都要检测一次。此外，新规的一大变化是“残留指标”是“无法检测的”，只能用“严格”来形容。有机食品是指来自有机农业生产体系的食品，有机农业是指在生产过程中不使用合成肥料、、生长调节剂和***的一种可持续农业，它强调加强自然生命和生物多样性的良性循环。 认证机构与获证***商定实施的新版认证标准和认证实施规则转换的检查可以结合监督、再认证或单独开展特殊检查等方式实施。

认证机构应具有充分的资源与技术能力以及完善的财务管理制度并且通过管理者及人员的培训和经历证明其技术能力。标准、检查与认证应覆盖产品和操作方的所有相关方面。 食品认证机构已经认证该食品的生产、加工、储存、运输和销售点符合有机食品标准，有机食品认证涵盖种植、养殖和加工的全过程。 我国有机产品认证工作由认监委***24家认证机构具体执行，每个认证机构都有各自的有机产品标志。而***也有统一的有机产品标志。

认证机构应保持公正。检查与认证活动应按照文件化程序的要求，在对相关因素做出客观评价的基础上进行。认证机构应有处理申诉的程序。 通过对修订前后的认证标准和认证实施规则的差异分析，确定认证标准和认证实施规则修订对认证机构运行过程和能力需求的影响分析。有机食品认证的一般程序包括：生产者向认证机构提出申请，提交符合有机生产加工要求的认证材料，认证机构对材料进行审查，并在现场检查后予以批准。