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在22 个省和新疆生产建设兵团452 个县全开展国家重点生态功能区县域生态环境质量考核工作，各相关省(区、市)会同省级财政组织好国家重点生态功能区县域生态环境质量考核，组织好被考核县的水、气的监测和数据填报工作，做好省级审核及抽查工作，加强县域生态环境质量考核，引导基层政府改善生态环境质量。

（4）揭示新的污染问题，探明污染原因，确定新的污染物质，为环境科研提供方向。

生态环境检测检测机构的职能是进行生态环境监测。环境监测的内容主要包括物理指标的监测、化学指标的监测和生态系统的监测。所谓生态环境监测，是指运用化学、物理、生物等技术手段，针对水和废水、环境空气和废气、海水、土壤、沉积物、固体废物、生物、噪声、振动、生态环境监测机构辐射等要素开展环境质量和污染排放的监测活动。