缺点：1需要安装三相分离器；

2进水中只能含有低浓度的悬浮固体；

3需要有效的布水器使其进料能均匀分布于消化器的底部；

4当冲击负荷或进料中悬浮固体含量升高,以及遇到过量***物质时,会引起污泥流失,要求较高的管理水平。

由于分离器的斜壁沉淀区的过流面积在接近水面时增加，因此上升流速在接近排放点降低。由于流速降低污泥絮体在沉淀区可以絮凝和沉淀。累积在三相分离器上的污泥絮体在一定程度上将超过其保持在斜壁上的摩擦力，其将滑回反应区，这部分污泥又将与进水有机物发生反应。

厌氧过程实质是一系列复杂的生化反应，其中的底物、各类中间产物、终产物以及各种群的微生物之间相互作用，形成一个复杂的微生态系统，类似于宏观生态中的食物链关系，各类微生物间通过营养底物和代谢产物形成共生关系或共营养关系。因此，反应器作为提供微生物生长繁殖的微型生态系统，各类微生物的平稳生长、物质和能量流动的***顺畅是保持该系统持续稳定的必要条件。