在综合利用方面，食用菌废料可生产沼气、饲养蚯蚓、加工有机肥（有改良土壤作用）等，因为菇渣养分丰富，ph值一般为 5 - 5.5，持水量为 372%，全氮为 1.62%，全磷为 0.454%， 氮为 212mg/kg，磷为 188mg/kg，有机质 60 - 70%，并含有丰富的微量元素。

除了可作为肥料使用外，还可以作为饲料、吸附剂和园林花卉即蔬菜的栽培基质；特别是经食用菌菌丝分解后的秸杆表面的角质层和硅细胞***及纤维，由于结构遭到***，所以质地疏松，气味芳香，适口性好，是一种营养价值高的饲料。

1、蘑菇渣发酵饲料，以1份菌渣配9份混合饲料。

2、发酵剂使用，每100份固体饲料，畜禽饲料、水产饲料等，使用EM原液0.1-0.3份，加等量糖蜜或红糖，用20-30份水稀释后均匀拌入固体饲料中，装入塑料袋或容器中密封发酵温度20℃以上，待出现酒曲醇香气味，即发酵成功。

3、水份含量掌握在一捏成团、一触即散。水份过多易腐，过少发酵不充分。密闭保存。可应用于畜禽及水产养殖。

蘑菇渣为原料,接种外源微生物,测定其对蘑菇渣堆肥的影响.结果表明:接种固氮菌的处理在低温天气中12~21 d仍能保持较高的温度,具有较好的保温作用;接种外源微生物对pH值影响较小;接种固氮菌处理在堆肥进行的46 d内,E4/E6值一直保持在较低的水平,较对照明显加快腐殖化作用。

经腐熟处理的蘑菇渣,其理化性质均能得到较大的改善;含水量为30%~35%的蘑菇渣腐熟效果很好,其次是含水量45%~50%,腐熟效果不好的是20%~25%和60%~65%含水量的蘑菇渣.