在制造的过程中，要求尽可能地不使用或少使用(或限制使用)化学肥料、化学和其他***。这就要求肥料首先要保护和促进被施物的生长和品质的提高；其次不使被施物产生和积聚***物质；第三不影响生态环境。微生物肥料基本符合以上三原则。近年来，我国已用具有特殊功能的制成多种微生物肥料，不但能缓和或减少农产品污染，而且能够改善农产品的品质。

偏酸性的土壤应避免再使用生理酸性肥料了，尤其是要减少***性复合肥这样的肥料使用。同时施用氮肥时也要适量，因为氮肥过多会导致土壤酸化。可以通过施用有机肥、秸秆还田等方法还减轻土壤酸化。施用碱性肥料的注意事项严禁与铵态肥料混用。铵态肥料主要是指由液态氨、氨水，以及氨跟酸作用生成的铵盐，如果使其与碱性肥料混用就会导致肥料中氨气的挥发，造成氮元素的减少，使肥效降低。

生物肥料加盟不能代替传统肥料生物肥料加盟主要是******菌群的生长，而不是以提供矿质营养养分为主，因此生物肥料加盟不会完全代替传统肥料，而是应当与化肥、有机肥等一同进入到土壤中，将作用发挥到大。提醒大家千万不要将生物肥料加盟与杀菌剂、***、***和含硫的化肥(如***钾等)以及稻草灰混合用。因为这些药、肥，很容易生物肥料加盟中的微生物。