目前，我国微生物肥料生产仍存在活菌数低、品种少、效果不稳定、成本和价格较高的问题。此外，该行业存在着大量的善恶混杂、不均衡和知识产权的现象，这也在一定程度上影响了微生物肥料的产业化进程，削弱了农民施用微生物肥料的积极性。此外，微生物肥料的生产需要***的机械设备，具备一定规模的工业生产条件(如造粒设备、干燥设备等)。)。只有开发生产微生物肥料机械设备，才能有效促进微生物肥料加工业的发展，为市场提供大量微生物肥料。

微生物君剂的主要功能:

1.提高土壤肥力:一些微生物制剂可以增加土壤中氮、磷、钾的含量；还能提高某些土壤的酶活性，有利于土壤中养分的转化，有利于植物的吸收和利用。此外，在微生物制剂的帮助下，会产生大量的二氧化碳，这可以提高土壤的保水保肥能力。

2.促进不溶性矿物质养分的释放:生物微生物制剂提高土壤酶活性，溶解不溶性土壤养分，促进植物吸收。同时，它还分泌一些能够分解有机物的有机酸物质，产生的糖有利于固氮菌的生长。

复合菌剂是有益的活性***。这些有益微生物由整个生态系统中存在的五类组成。在复合菌剂的菌液中，将对人类有益的好氧和厌氧有益微生物以适当的比例和的发酵工艺混合培养，形成各种微生物群落。它们在自己和彼此的生活中生长在母体(食物)中。通过这种共生增殖关系，它们形成了复杂而稳定的微生物系统，形成了强大而的优势。光合***(需氧和厌氧)光合***和蓝藻是***的营养微生物。菌体本身含有60多种蛋白质，富含多种***，还含有辅酶O10、抗病毒物质和生长促进因子。