菌群中的地衣芽孢等有益微生物施入土壤层后快速繁育成优点菌群，操纵化感营养成分和資源，使重茬、根腐、猝倒、牙床流动性、灰霉病等病原菌丧失生存环境和标准。绿色植物根茎体细胞植物细胞变厚、肝纤维化、木制化，转化成角质层两层，产生牢固天然屏障，避免病原菌***。绿色植物群中有益微生物如地衣芽孢、极大芽孢和侧孢芽孢能够提高土壤层缓存能力，维持水份和水份，提高农作物的耐旱、耐寒和耐涝能力。与此同时，侧生胞子的胞子链球菌也可以加强叶子防护膜，抵御病原菌的感柒，抵御病害。

例如，过磷酸钙容易被土壤固定，与菌肥混合后不能施用，从而减少了化肥与土壤的接触面，降低了养分的固定。同时，化肥也可以被***肥料吸收和储存，以减少养分流失。此外，当大量化肥单独施用或化肥施用不均匀时，容易对作物产生毒***，如果化肥与菌肥混合后施用，就不会出现这种问题。同时，由于化肥只能为作物提供一种或多种养分，长期施用会导致作物养分缺乏，微生物菌肥含有大量有益微生物，可以改善土壤理化性质和微生态菌群，增强土壤中酶的活性，有利于养分转化。此外，当微生物菌肥用作冲施的追肥时，由于其本身的养分含量不高，如果单独使用，可能不足以满足作物正常生长的养分需求，所以醉与化肥混合均匀。

微生物肥料的种类很混乱，许多种植者无法分辨它们是微生物制剂还是***肥料。微生物菌剂和菌肥的区别主要在于产品中营养物质和有机物质的含量。有必要结合实际需要选择合适的产品。人们认为产品中***的种类和数量越多，产品越好。这也是错误的。复合菌剂的效果受不同军种生长习性的影响。盲用化合物容易引起君种间的拮抗，影响应用效果。请注意，只有活菌在产品中真正发挥作用，所以活菌越有效，效果越好。物种的纯度也非常重要。当产品中霉菌和***的数量和比率超过标准时，使用效果也会受到影响。