是指有源（病者或病原携带者）存在的地区，进行消毒，以免病原体外传。疫源地消毒又分为随时消毒和终末消毒二种。能杀灭***繁殖体（分枝除外）和亲脂类病毒的化学消毒方法以及通风换气、冲洗等机械法。如采用季铵盐类***（苯扎铵等）、双胍类***（氯己定）等，在规定的条件下，以合适的浓度和有效的作用时间进行消毒的方法。终末消毒是指源住院隔离，痊愈或后，对其原居地点进行的消毒，以期将病所遗留的病原微生物消灭。

仅靠消毒措施还不足以达到以上目的。须同时进行必要的隔离措施和工作中的无菌操作，才能达到控制之效。酸性环境中杀菌力强而迅速，高浓度能芽胞，中用于粪、痰、脓液等的消毒。每升加干粉200克，搅拌均匀，放置1～2小叶，尿每升加干粉5克，放置10分钟即可。消毒是指病原微生物、但不一定能***芽孢的方法。通常用化学的方法来达到消毒的作用。用于消毒的化学叫做***。

***孢子对紫外线抵抗力很强，但较易被电离辐射所杀灭。肠道病毒对的耐受力与***繁殖体相近，但季胺盐类对之无效。易为碱***，但对酸耐受力强。终末消毒是指源住院隔离，痊愈或后，对其原居地点进行的消毒，以期将病所遗留的病原微生物消灭。0.2%1小时可杀灭***繁殖型，5%2小时可杀灭，杀灭芽胞需10小时以上。各种铵盐可促进其杀菌作用。

—T（chloramine T） 为有机氯***，含有效氯24～26%，性较稳定，密闭保持1年，仅丧失有效氯0.1%。微溶于水（12%），刺激性和腐蚀性较小，作用较次氯酸缓慢。1～2.5%溶液对病毒亦有作用。活性液体须用前1～2小时配制，时间过久，杀菌作用降低。呼吸道病，病原体随呼吸、咳嗽、喷嚏而排出，再通过飞沫和尘埃而播散，污染范围不确切，进行消毒较为困难。须同时采取空间隔离，才能中断。虫媒病则采取杀虫灭鼠等方法。