就是具有自动清洗程序的全自动生化分析仪也有交叉污染，例如Beckman 全自动生化分析仪CX4，它的***针(probe)、样品吸样针及反应搅拌棒是利用高压冲洗洗液冲洗，然后用高压压缩空气吹干，有时由于洗液压力和压缩空气压力偏低，使***吸针、样品针及反应搅拌棒冲洗不干净、吹不干，从而导致反应池之间相互污染、***间交叉污染，是检验结果偏离。另一个值得注意的问题是许多生化仪器由于长期频繁的利用，使加样针和***针的磨损加重或的“特氟龙”吸头不及时更换，使吸样针或***针密封层增大，产生***现象也是造成样本间及实际间项目污染的一个重要原因。

Mg放在ALP等含有镁离子项目后面可能会使检测结果偏高或重复性差。Ca放在a-amy项目后面可能会使检测结果偏高或重复性差，Mg***（calmagite法）中含有EGTA，会干扰Ca的测试结果。另外我们发现相邻两个项目的PH值相差较大或反应对PH要求严格的项目，也会对测定结果产生影响， TBA放在TP,ALB,UA,后边测定，会使测定结果偏低等等。解决办法：a、调整试验的前后顺序来消除这种影响；b、在造成污染的项目和受污染的项目之间设置清洗并设定清洗的次数。

全自动生化分析仪属于光学分析仪器，本质就相当于一个分光光度计，基于物质对光的选择性吸收，即分光光度法，基本测量原理还是依据比尔定律。单色器将光源发出的复色光分成单色光，特定波长的单色光通过盛有样品溶液的比色池，光电转换器将投射光转换为电信号后送入信号处理系统进行分析，计算机再根据用户选择的工作方式对测量数据进行处理、运算、分析、保存，打印机同时打印出相应的结果。