不过，就像海绵城市建设需要因地制宜进行科学规划一样，雨水再利用系统也要结合城市特点进行设计。相对于其他污水来说，雨水净化更简单一些，就地消纳或者远程调用难度都比较低，还能在“吸收”的基础上帮助祛除“城市病”，社会和经济效益显著。也正是如此，近年来各地对于雨水收集和利用都非常重视。从地下管网更新，到引进自动化设备，或是植树、种草、开园，引人瞩目的就是海绵城市建设，雨水再利用被提上日程。

人工清洁会利用管道输送，过滤网拦截，沉淀装置收集，排污管控流，并且配备提升泵、填料、曝气设备和深度处理池等设施。自然处理方式则主要是通过修建人工池塘或洼地，开凿生态植草沟，围出绿地滞蓄带等方式，一方面调节水流，起到缓冲和蓄水作用，另一方面实现自然沉淀和净化。也有一部分城市会开辟出生物滞留池，留出草地、林地，甚至于打造一个植被繁茂的景观花园，既能防止水土流失，又能涵养土壤，还能辅助截污分流与净化，为城市新添一处景观，一举多得。

在收集工作顺利的情况下，雨污分流关系着后续过滤、杀菌等程序是否能进行。因此，雨水资源利用也对当今城市地下管廊建设提出了更高的要求，例如截污挂篮、弃流装置以及蓄水池之类的设施需求上涨。雨水利用的第三步就是过滤和清洁，一般利用方式不同，清洁流程设定也会有差异。总的来说，过滤和清洁分为大的两类，一种是人工，一种是自然。