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根据其结构，可以分为纤维胶原、基膜胶原、微纤维胶原、锚定胶原、六边网状胶原、非纤维胶原、跨膜胶原等。根据它们在体内的分布和功能特点，可以将胶原分成间质胶原、基底膜胶原和细胞外周胶原。间质型胶原蛋白分子占整个机体胶原的绝大部分，包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型胶原蛋白分子，Ⅰ型胶原蛋白主要分布于皮肤、肌腱等***，也是水产品加工废弃物。

虽然在1984年已经从鲨鱼的中分离出来Ⅱ型胶原，但是从水产动物提取Ⅱ型胶原的研究并不多。 [38-39] ⅩⅧ型胶原发现的相对较晚，同源性较高，还有不同的亚类，主要存在于肺、和脏等***中。属于被称之为multi-plexin的特殊胶原亚族。

而一般陆生哺乳动物蛋白质中羟脯氨酸和焦谷氨酸的含量极微少。与陆生动物相比，水生动物中的胶原蛋白，其脯氨酸和羟脯氨酸的总量少，而含硫元素的蛋氨酸（Met）含量要远大于陆生动物中的胶原蛋白。灰星鲨鱼皮、骨胶原蛋白的电泳图谱 [79]一级结构是组成胶原蛋白多肽链的氨基酸序列；胶原蛋白分子是由3条左手螺旋。

胶原蛋白的提取一般有三种方法：一是高压辅助的物理方法；二是用溶剂预处理结合低温或热水抽提的化学方法，根据溶剂的不同，可分为热水浸提法、酸法、碱法、盐法；三是用酶的生***学法。一般来说，高压辅助和热水抽提针对明胶的提取。