这一阶段应严格控制挖土的程序和深度，注意要均匀挖土，对于结构体大的井体，根据需要，必须安排多个作业面，同时对称均匀挖土。实际上在挖土下沉时不可能是竖直均匀下沉，每沉一次，难免有些倾斜，继续挖土时，可在井体倾斜的反方向一边增大挖土量。沉井下沉时，有时会产生偏斜、下沉速渡过快或过慢等情形，此时应细心调查原因，调剂挖土次序和消除施工障碍，甚至借助卷扬机进行纠偏。内隔墙、高低横梁及框架能增添沉井的总体刚度，使沉井壁减薄，使沉井底、顶、壁跨度减小，经济公道。这些结构虽不直接蒙受水、水压力，但它是地下构筑物的一部分，仍利用防水混凝土浇筑。

沉井施工时，需先将场地平整，在基坑上展设必定厚度的砂层，在刃脚地位再展设垫木。然后再垫木上制造刃脚和节沉井。当沉井缓凝强度达70%时，才可拆除垫木，挖土下沉。为进步混凝土沉井的防水性能，减少沉井下沉时的摩擦阻力，好在混凝土沉井拆模后，在沉井的外壁做防水砂浆抹面。当沉井降落到设计标高后，沉井地面用混凝土封底，以防地下水渗透井内。当沉井仅作为穿过地表含水层在不透水层中构筑隧道出入口时，可不用封底，但须封住地下水下渗的途径。

根据不同土质情况，采用不同的挖土顺序，分层开挖，使挖土对称均匀，刃脚均匀受力，沉井均匀、竖直平稳下沉。下沉通过粘土胶结层或沉井自身重力偏轻下沉困难时，可采用井外高压射水、降低井内水位等方法下沉。在结构受力容许的条件下，亦可采用压重或接高沉井下沉。沉井挖土必须事先制定好挖土计划、合理配备施工人员和机械设备。沉井开始下沉阶段，井体入土的深度不大，井体下沉时所受的土方阻力较小，并且此时由于沉井大部分还在地面以上，侧向土体的约束作用很小，稳定性较差，所以沉井容易产生偏移和倾斜。