沉井下沉至设计标高后，应进行沉降观测，待8h内累计下沉量不大于10mm时，方可进行封底。沉井封底时影响沉井防水后果的要害，封底有拍摄封底和不排水封底。（即干封底和水下封底）两种方式。这一阶段应严格控制挖土的程序和深度，注意要均匀挖土，对于结构体大的井体，根据需要，必须安排多个作业面，同时对称均匀挖土。实际上在挖土下沉时不可能是竖直均匀下沉，每沉一次，难免有些倾斜，继续挖土时，可在井体倾斜的反方向一边增大挖土量。刃脚第平面称为踏面，其宽度视所遇土层的软硬及井壁重量、厚度等二定，一般不大于15cm。当需穿过坚硬土层或岩层时，踏面宜用钢板或角钢维护。

内隔墙间距一般不超过5～6m，其厚度一般为0.3～0.4m。内隔墙墙底面应比刃脚踏面高出0.5m以上，以免妨害沉井下沉。沉井井壁既是施工时挡土和防水的围堰，又是构造外墙，所以要求井壁有足够强度和抗渗性。在地层的侧压力和地下水的渗透压力作用下，不致损坏变形或渗漏。为进步混凝土沉井的防水性能，减少沉井下沉时的摩擦阻力，好在混凝土沉井拆模后，在沉井的外壁做防水砂浆抹面。

在软粘性土层中，对下沉系数不大的沉井，采取连续挖土，连续下沉，中间停歇时间不要过长。采用射水法即在井壁腔内的不同高度处对称预埋射水管，在井壁外侧留有喇叭口朝上方的射水嘴，遇下沉缓慢或停沉时，用高压水射水以减少井壁与土层之间的摩阻力。引起沉井偏斜的原因，可能是沉井在制作时，就出现歪斜或挖土出现不均匀或地层土质软硬不均匀或井外侧临时堆土不当或沉井底部的一部分遇到障碍物等，都会引起沉井偏斜。沉井倾斜如受地下水方向影响时，先挖背水方面的土，后挖迎水方向的土。沉井挖出的土方好及时外运，即使条件不允许，也应搬运至离井壁四周影响范围之外处，且四周均匀堆放。