【从植物材料或植物培养细胞中提取***组DNA】
① 按下表称取适量的新鲜植物材料(如选用的是冷冻干燥植物材料,则用量减半),剪成小块放入研钵中,加入液氮,待样品冷冻完全后快速、用力研磨至粉末状。研磨时应间断加入液氮以防止材料融化。
植物材料使用量 植物花、叶片10~100 mg 植物茎60~240 mg 植物根80~240 mg 植物种子80~240 mg 如选取植物的根、种子等样品时,因其***组DNA含量很低,需使用超过表格中所示的参数用量,此时请分两管进行步骤1~6的实验操作,在步骤7的操作中再将各管溶液分次加入至同一Spin Column中过滤,使各管的***组DNA结合到同一个Spin Column上。如从培养的植物细胞中提取***组DNA,请离心收集2×103~1×107的培养植物细胞,加入150 μl水充分悬浮细胞后移入研钵中,加入液氮后快速、用力研磨至粉末状。
注)样品研磨应充分,否则将会严重影响***组DNA的收率。
② 将研钵移至65℃水浴,当样品粉末刚开始融化时,向研钵中加入700 μl的Solution A和1.2 μl的RNase A1,用力碾磨30秒。
③ 收集650 μl研磨好的***匀浆移至Collection Tube中。如匀浆体积不足650 μl,请补充Solution A至650 μl。65℃保温15分钟。注)处理富含纤维的根/茎等植物材料或富含淀粉、蛋白质的种子等时,可延长水浴时间至60分钟。
转移RNA
转移RNA(tRNA)在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%~15%,绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鉴定。
tRNA一级结构具有以下特点:
①是一类单链小分子RNA,长73~95nt(共有序列76nt),沉降系数4S。
②是含稀有碱基***多的RNA,含7-15个稀有碱基(占全部碱基的15%~20%),位于非配对区。
③5′末端碱基往往是鸟piao呤。
④3'端是CCA序列,其中的腺苷酸常称为A76,其3’—OH是氨基酸结合位点。
与DNA不同,RNA一般为单链长分子,不形成双螺旋结构,但是很多RNA也需要通过碱基配对原则形成一定的二级结构乃至三级结构来行使生物学功能。
RNA的碱基配对规则基本和DNA相同,不过除了A-U、G-C配对外,G-U也可以配对。
在细胞中,根据结构功能的不同,RNA主要分三类,即tRNA(转运RNA),rRNA(核糖体RNA),mRNA(信使RNA)。mRNA是合成蛋白质的模板,内容按照细胞核中的DNA所转录;tRNA是mRNA上碱基序列(即遗传密码子)的识别者和氨基酸的转运者;rRNA是组成核糖体的组分,是蛋白质合成的工作场所。
棉花等酚类、多糖类物质较多的植物DNA提取法:
1 取2g新鲜幼嫩的叶片放入研钵中,加入液氮后快速、充分研磨,待成极细的粉末状时迅速转入到50ml离心管中。
2 在50ml离心管中加入10ml冰预冷的提取缓冲液,在涡悬振荡器上充分混匀。
3 于4℃,2700×g离心20分钟,倒去上清液。
4 在沉淀中加入5ml裂解缓冲液,在涡旋振荡器上充分混匀。
5 于65℃水浴锅中温育30min。
6 加入5ml氯1仿/异戊1醇(24/1),并上下翻转以充分混合。
7 于4℃,2700×g离心5分钟。
8 转移上层水相至一新的50ml离心管中。
9 重复步骤7-9一次。
10 加入2/3体积的冰预冷的异丙1醇,并上下翻转以充分混合,至-20℃2h。
11 于4℃,1200×g离心10min。
12 在一新管中加入20ml含80%乙醇15mmol/LNaAc溶液,用玻棒将DNA转入该管(如不能直接用玻棒缠出,可离心后倒出上清,再在其中加入20ml含80%乙醇15mmol/LNaAc溶液),放置20min后稍许离心,移走上清并吸出残存乙醇,室温干燥。
13 加入1 0mlTE(10mmol/LTris-HClPH=8 0,1mmol/LEDTA)并加入终浓度为20(g/L的RNaseA,过夜。
14 风干,用50μlTE缓冲液溶解,存于-20℃备用。
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