PCR方法已广泛用于科研,在工业中也有不断扩大应用的趋势,它包括检测一些病原体、检测支原体污染、检测***污染以及检测残留宿主DNA等。
PCR在工业中的应用主要存在一个方法验证的问题,尤其是灵敏度的验证。灵敏度不够,就会发生漏检。另外,PCR所直接面对的样本是DNA,而非病原菌或DNA,因此还需要做DNA抽提,这也是要注意的。
因此,如能采用PCR检测支原体并替代药典方法,还是能节省很多时间和精力。但PCR方法的验证需要较为完整。灵敏度验证是一个重要方面。灵敏度不够,就会发生漏检。《欧洲药典》第2.6.7章(EP 2.6.7)和《日本药典》第十七版第G3章(JP G3),都规定,对于核酸扩增法(如PCR)检测支原体,如替代传统的培养法,都要求检测限达到10 CFU/ml。
具体验证可使用10CFU的支原体灵敏度标准品,它一般为冻干粉形式,需要用待测样本的样本基质(需保证里面不含支原体)来复溶,再进行DNA抽提以及PCR检测。如检测的电泳有条带,或者qPCR检测后的Ct值小于40,即表明检测成功。
DNA提取***盒是根据氯化芐法构建的,能够从样本中提取***组DNA的***盒。氯化1苄具有能将含有纤维素等的细胞壁中的羟基苄基化,从而***细胞壁的特性。本制品利用了氯化1苄的这一特性,将植物样品***融解后,再使用Pipet Tip的尖1端将植物样品在Microtube壁上数次按压即可***细胞壁。本法与传统方法相比,省去了液氮研磨等烦琐步骤,有利于一次性处理大量样品。而且,本制品经过了改良,热处理时间只需15分钟,使用本制品从实验开始至水相回收只需30分钟时间。得到的***组DNA可以进行PCR扩增及限制酶处理等。
DNA提取***盒主要可以分为以下几大类:小量全血***组DNA提取***盒、中量全血***组DNA提取***盒、***/细胞***组DNA提取***盒、中量/大量***/细胞***组DNA提取***盒、全血/***/细胞***组DNA提取***盒、CTAB植物***DNA提取***盒、新型植物***组DNA提取***盒、酵母***组DNA提取***盒、M13噬菌体单链***组DNA提取***盒。
从动物***中提取***组DNA
使用研钵进行匀浆时:
① 取1~100 mg的动物***或人***移入冰浴预冷的研钵中,快速用力展研成匀浆。注)下列***请加液氮研磨至粉末状。
A.富含DNA酶的胰脏、脾1脏、胸腺、淋巴等***。
B.富含胶原蛋白的皮肤、肌腱等***。
C.富含角质蛋白的***或坚硬的***(如骨骼)等。
② 加入650 μl的Solution A和0.9 μl的RNase A1,温和研磨30秒钟。注)使用上述①-注)的实验材料时,请在加入Solution A及RNase A1后,将研钵置于65℃水浴上研磨1分钟。
③ 收集650 μl研磨好的***匀浆液移至Collection Tube中。如果匀浆体积不足650 μl,请补充Solution A至650 μl,65℃保温5分钟。
使用研磨棒进行匀浆时:
① 取1~100 mg的动物***或人***移入冰浴预冷的Collection Tube 中,用研磨棒快速研磨成糊状。
② 加入350 μl的Solution A和0.9 μl的RNase A1后用研磨棒快速研磨成匀浆。
③ 加入350 μl的Solution A将研磨棒上的匀浆冲入Collection Tube中,充分振荡混合后,65℃保温5分钟。
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