分子克1隆
PCR被广泛应用于目标DNA部分片段的克1隆,该技术被称为 PCR 克1隆。在直接PCR克1隆中,DNA(如,gDNA、cDNA、质粒DNA)的目标区域被扩增并插入到特殊设计的兼容载体中。
除了制备插入片段,PCR也是一种在在克1隆后筛选克1隆是否携带目标插入片段的有效方法。引物经过设计,可以用于确定载体中插入片段是否存在和插入方向。
突变:PCR克1隆的一大优点是能够通过克1隆将所需突变引入目的***中,以便进行突变研究。在 定1点突变中,经过设计的PCR引物可将碱基置换、删除或插入整合到特定序列中。引物***到已克1隆至质粒中的序列上。随后,含有引入突变的PCR产物通过自我连接,重新生成环状质粒,并用于转化感受态细胞。
测序:PCR是为测序富集模板DNA的一种相对简单的方法。为保证DNA序列准确性,强烈建议使用高保真PCR来制备测序模板。在 Sanger测序中,PCR扩增片段经纯化并用于测序反应。使用常用的测序引物结合位点对PCR引物的 5′末端进行标记,以简化测序工作流程。
二代测序 (NGS)中,PCR被广泛用于构建DNA测序文库。在NGS文库制备中,DNA样品通过PCR反应富集(在起始量有限的情况下)并使用adaptor(以及用于多重检测的index)标记。除了具有高保真度,DNA聚合酶还应具有***小的扩增偏好性,从而使测序文库具有高覆盖度。
普通的PCR仪
把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪,叫传统的PCR仪,也叫普通PCR仪。
它是由主机,加热模块,PCR管,热盖,控制软件组成。根据DNA部分片段高温解链,降温配对聚合原理,通过循环改变加热模块的温度,微量不易于分辨的的DNA部分片段进行扩增成大量的DNA部分片段,从而对其进行分析鉴定。根据需要可结合电泳仪,水平电泳槽,一起应用。如果要做不同的退火温度需要多次运行。主要是做简单的,对目的***退火温度的扩增。
该仪器主要应用于***临床检验,食品检测,科研机构,高等院校教学对遗传变异,***表达等进行研究。
目前的病毒核酸检测***盒,多数采用荧光定量PCR方法,通过检测荧光信号的累积来确定样本中是否含有病毒核酸。那么,核酸检测到底需要经过哪些步骤呢?概括起来,是 取样、留样、保存、核酸提取和上机检测五个步骤。
取样
采集***的分泌物。用鼻咽拭子或咽拭子擦拭鼻腔或咽后壁及双侧扁桃体处
留样
将拭子头浸入细胞保存液中,折断尾部后立即旋紧管盖
保存
将样本管放入密封袋中保存好,并及时送检
核酸提取
将样本送进实验室进行核酸提取
上机检测
将提取物进行荧光PCR扩增反应
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