核糖核酸(缩写为RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A(腺piao呤)、G(鸟piao呤)、C(胞***H4N2)、U(尿***H4N2),其中,U(尿***H4N2)取代了DNA中的T。核糖核酸在体内的作用主要是引导蛋白质的合成。
***一个细胞含RNA约10pg(含DNA约7pg)。与DNA相比,RNA种类繁多,分子量较小,含量变化大。RNA可根据结构和功能的不同分为信使RNA和非编码RNA。非编码RNA分为非编码大RNA和非编码小RNA。非编码大RNA包括核糖体RNA、长链非编码RNA。非编码小RNA包括转移RNA、核酶、小分子RNA等。小分子RNA(20~300nt)包括 miRNA、 SiRNA、 piRNA、scRNA、 snRNA、 snoRNA等,***也有小分子RNA(50~500nt)。
RNA抽取一般使用Trizol法抽提:
Trizol是一种总RNA抽提***,内含异硫qing酸胍等物质,能迅速裂解细胞,***细胞释放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法进行提取***或细胞中的RNA。
Trizol作用原理:
在匀质化或溶解样品中,Trizol***可保持RNA的完整性,同时能***细胞及溶解细胞成分。加入氯1仿离心后,裂解液分层成水相和有机相。RNA存在于水相中。
水相转移后,RNA通过异丙1醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇可从中间相沉淀得到DNA,加入异丙1醇沉淀可从有机相得到蛋白质。
棉花等酚类、多糖类物质较多的植物DNA提取法:
1 取2g新鲜幼嫩的叶片放入研钵中,加入液氮后快速、充分研磨,待成极细的粉末状时迅速转入到50ml离心管中。
2 在50ml离心管中加入10ml冰预冷的提取缓冲液,在涡悬振荡器上充分混匀。
3 于4℃,2700×g离心20分钟,倒去上清液。
4 在沉淀中加入5ml裂解缓冲液,在涡旋振荡器上充分混匀。
5 于65℃水浴锅中温育30min。
6 加入5ml氯1仿/异戊1醇(24/1),并上下翻转以充分混合。
7 于4℃,2700×g离心5分钟。
8 转移上层水相至一新的50ml离心管中。
9 重复步骤7-9一次。
10 加入2/3体积的冰预冷的异丙1醇,并上下翻转以充分混合,至-20℃2h。
11 于4℃,1200×g离心10min。
12 在一新管中加入20ml含80%乙醇15mmol/LNaAc溶液,用玻棒将DNA转入该管(如不能直接用玻棒缠出,可离心后倒出上清,再在其中加入20ml含80%乙醇15mmol/LNaAc溶液),放置20min后稍许离心,移走上清并吸出残存乙醇,室温干燥。
13 加入1 0mlTE(10mmol/LTris-HClPH=8 0,1mmol/LEDTA)并加入终浓度为20(g/L的RNaseA,过夜。
14 风干,用50μlTE缓冲液溶解,存于-20℃备用。
用乙醇沉淀DNA时为什么一定要加NaAc或N***
在pH为8左右的溶液中,DNA分子是带负电荷的,加一定浓度的NaAc或N***,使Na+中和DNA分子上的负电荷, 减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀,当加入的盐溶液浓度太低时, 只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全,当加入的盐溶液浓度太高时, 其效果也不好。在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须要进行洗涤或重沉淀。
加核糖核酸酶降解核糖核酸后,为什么再要用SDS与KAc来处理?
加进去的RNase本身是一种蛋白质,为了纯化DNA,又必须去除之,加SDS可使它们成为SDS-蛋白复合物沉淀,再加KAc使这些复合物转变为溶解度更小的钾盐形式的SDS-蛋白质复合物,使沉淀更加完全。也可用饱和酚、*抽提再沉淀,去除RNase。在溶液中,有人以KAc代替NaAc,也可以收到较好效果。
在***操作实验中,磷酸盐缓冲系统(pKa=7.2)和硼酸系统(pKa=9.24)等虽然也都符合细胞内环境的生理范围(pH),可作DNA的保存液,但在转化实验时,磷酸根离子的种类及数量将与Ca2+产生Ca3(PO4)2沉淀,在DNA反应时,不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,有的要求高离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用Tris-HCl(pKa=8.0)的缓冲系统,由于缓冲液是TrisH+/Tris,不存在金属离子的干扰作用,故在提取或保存DNA时,大都采用Tris-HCl系统,而TE缓冲液中的EDTA更能稳定。
版权所有©2024 产品网