信使RNA(mRNA)早先发现于1960年,在蛋白质合成过程中负责传递遗传信息、直接指导蛋白质合成,具有以下特点。
1.含量低,占细胞总RNA的1%~5%。
2.种类多,可达105种。不同***表达不同的mRNA。
3.寿命短,不同mRNA指导合成不同的蛋白质,完成使命后即被降解。***mRNA的平均半衰期约为1.5分钟。脊椎动物mRNA的半衰期差异极大,平均约为3小时。
4.长度差异大哺乳动物mRNA长度为5×102~1×105nt原核生物与真核生物的mRNA虽然在结构上有差异,但功能一样,都是指导蛋白质合成的模板。
总RNA的抽提方法:
目前常用的方法是用异硫qing酸胍苯1酚抽提法。
提取步骤:
先用液氮研磨材料,匀浆,加入Trizol***,进一步破碎细胞并溶解细胞成分。然后加入氯1仿抽提,离心,分离水相和有机相,收集含有RNA的水相,通过异丙1醇沉淀,获得比较纯的总RNA,用于下一步mRNA的纯化。也可将含有RNA样品的细胞破碎液通过硅胶膜纯化柱纯化。
RNA浓度和纯度判断:
OD260为1时相当于浓度为50 ug/mL;
OD260/0D280值在1.8~ 2.0之间,表示纯度较好;
0D260/OD280值低于1.8,样品有蛋白质或酚污染;
0D260/0D280值大于2.0,提取的RNA可能有降解;
电泳后如果rRNA大小完整,而且28S rRNA和18SrRNA亮度接近2:1、mRNA分布均匀,则认为RNA。
棉花等酚类、多糖类物质较多的植物DNA提取法:
1 取2g新鲜幼嫩的叶片放入研钵中,加入液氮后快速、充分研磨,待成极细的粉末状时迅速转入到50ml离心管中。
2 在50ml离心管中加入10ml冰预冷的提取缓冲液,在涡悬振荡器上充分混匀。
3 于4℃,2700×g离心20分钟,倒去上清液。
4 在沉淀中加入5ml裂解缓冲液,在涡旋振荡器上充分混匀。
5 于65℃水浴锅中温育30min。
6 加入5ml氯1仿/异戊1醇(24/1),并上下翻转以充分混合。
7 于4℃,2700×g离心5分钟。
8 转移上层水相至一新的50ml离心管中。
9 重复步骤7-9一次。
10 加入2/3体积的冰预冷的异丙1醇,并上下翻转以充分混合,至-20℃2h。
11 于4℃,1200×g离心10min。
12 在一新管中加入20ml含80%乙醇15mmol/LNaAc溶液,用玻棒将DNA转入该管(如不能直接用玻棒缠出,可离心后倒出上清,再在其中加入20ml含80%乙醇15mmol/LNaAc溶液),放置20min后稍许离心,移走上清并吸出残存乙醇,室温干燥。
13 加入1 0mlTE(10mmol/LTris-HClPH=8 0,1mmol/LEDTA)并加入终浓度为20(g/L的RNaseA,过夜。
14 风干,用50μlTE缓冲液溶解,存于-20℃备用。
鼻咽拭子的采集
被采集人员需要 保持头部不动,采样人员去除鼻腔内壁的分泌物。然后采样人员一手轻扶被采集人员头部,一手将鼻咽拭子缓缓插入鼻腔至鼻咽部。在鼻咽部,拭子将停留数秒吸取分泌物,而后采样人员轻轻旋转取出拭子,将样本保存并送检。
咽拭子的采集
被采集人员先用 生理盐水漱口,采样人员将拭子放入无菌生理盐水中湿润。被采集人员头部微仰并保持不动,嘴张大,并发“啊”音,露出两侧咽扁桃体,采集人员将拭子越过舌根,在被采集者两侧咽扁桃体稍微用力来回擦拭至少3次,然后再在咽后壁上下擦拭至少3次。
需要注意的是,两种采集方法, 被采集人员均会稍感不适,所以在采样的过程中,被采集人员需稍稍克服一下不适感, 配合采样人员的工作。不可过度活动头部,以免拭子划伤粘膜。如被采集人员发生刺激性咳嗽,采集过程需稍作暂停。
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