RNA***盒注意事项
所有相关器皿耗材都应为RNase-free产品,操作过程要小心,带口罩、手套避免环境中RNA酶污染样品。
RNA在水溶液中OD值可能在1.5-1.9之间,但这并不表示RNA不纯,需电泳检测。
使用时一定要根据自己的实验需要购买专1用提取***盒, 如果不是专1用***盒,或许能提出RNA,但不能确保其质量以及完整性,会影响RT-PCR、Northern blot、Dot blot、Real time RT PCR、芯片分析、polyA 筛选、体外翻译、RNase 保护分析、分子克1隆等后续实验的结果。
当前提取效果好的是RNA提取***盒,但其售价较高,单次实验费用花费太大,对精度要求不高的实验没有必要购买,当然还有其它的进口***盒,但是均存在价格高、订货周期长的问题(如果碰上国内无货的时候,要从国外发货,会等很长一段时间)。普通的提取实验用国产的***盒就足以,价格不高,基本上各地均有现货,如天根(国内生产的***盒中销售面比较广的一种)等,其价格比进口***盒要便宜许多,且效果还不错,还可以
RNA抽取一般使用Trizol法抽提:
Trizol是一种总RNA抽提***,内含异硫qing酸胍等物质,能迅速裂解细胞,***细胞释放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法进行提取***或细胞中的RNA。
Trizol作用原理:
在匀质化或溶解样品中,Trizol***可保持RNA的完整性,同时能***细胞及溶解细胞成分。加入氯1仿离心后,裂解液分层成水相和有机相。RNA存在于水相中。
水相转移后,RNA通过异丙1醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇可从中间相沉淀得到DNA,加入异丙1醇沉淀可从有机相得到蛋白质。
用乙醇沉淀DNA时为什么一定要加NaAc或N***
在pH为8左右的溶液中,DNA分子是带负电荷的,加一定浓度的NaAc或N***,使Na+中和DNA分子上的负电荷, 减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀,当加入的盐溶液浓度太低时, 只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全,当加入的盐溶液浓度太高时, 其效果也不好。在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须要进行洗涤或重沉淀。
加核糖核酸酶降解核糖核酸后,为什么再要用SDS与KAc来处理?
加进去的RNase本身是一种蛋白质,为了纯化DNA,又必须去除之,加SDS可使它们成为SDS-蛋白复合物沉淀,再加KAc使这些复合物转变为溶解度更小的钾盐形式的SDS-蛋白质复合物,使沉淀更加完全。也可用饱和酚、*抽提再沉淀,去除RNase。在溶液中,有人以KAc代替NaAc,也可以收到较好效果。
在***操作实验中,磷酸盐缓冲系统(pKa=7.2)和硼酸系统(pKa=9.24)等虽然也都符合细胞内环境的生理范围(pH),可作DNA的保存液,但在转化实验时,磷酸根离子的种类及数量将与Ca2+产生Ca3(PO4)2沉淀,在DNA反应时,不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,有的要求高离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用Tris-HCl(pKa=8.0)的缓冲系统,由于缓冲液是TrisH+/Tris,不存在金属离子的干扰作用,故在提取或保存DNA时,大都采用Tris-HCl系统,而TE缓冲液中的EDTA更能稳定。
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