在厌氧反应器中接种污泥的数量直接关系到反应器的类型和大小。以第三代厌氧内循环反应器IC为例，厌氧颗粒污泥的大接种量约为IC反应器有效容积的50-55%，而其他类型厌氧反应器的接种量相对较小，接种量约为IC反应器有效容积的50-55%。在厌氧反应器生物启动前，若能确定需处理的废水量和相应的SCOD浓度，则可以理解污泥负荷的概念，选择合适的污泥负荷，并根据上述计算公式计算出需接种的厌氧污泥量。好的颗粒污泥有良好的沉降速度，取1L的量筒，加清水至刻度线，将颗粒污泥少量加入，计算从1L刻度线沉到底部的时间，从而计算颗粒污泥的沉降速度，一般在20-80m/h的速度都能满足要求。

作为接种污泥时，需要注意有硬核大颗粒的数量，硬核大颗粒数量越多，污泥的无机化程度越高，活性则越低。在处理黄原胶废水IC反应器中，培育出了白色的颗粒污泥，当污泥接种至造纸废水中后，出现了严重的脱皮现象，颗粒污泥从外到内逐层脱皮，并随废水流出反应器，而新形成颗粒污泥为黑色，并且保持了较好的处理效率。厌氧颗粒污泥基于20世纪80年代初发展起来的生物颗粒污泥技术，是在高的水力剪切下，由产菌、产菌和水解发酵菌等构成的，沉降性优于活性污泥絮体的自凝聚体。

颗粒大小不太均匀，颗粒太大、表面不够光滑、有脱皮或“长毛”等现象，颗粒硬度小，IC反应器的取泥口取泥时打到手上没有明显的颗粒感，这属于一般的颗粒污泥。破碎的颗粒污泥较多、颗粒碎片和絮状泥占大多数的污泥，属于很差的颗粒污泥。其中的有效颗粒较少，接种后启动时要注意控制水力负荷和污泥负荷，保持反应器的运行稳定。在处理黄原胶废水IC反应器中，培育出了白色的颗粒污泥，当污泥接种至造纸废水中后，出现了严重的脱皮现象，颗粒污泥从外到内逐层脱皮，并随废水流出反应器，而新形成颗粒污泥为黑色，并且保持了较好的处理效率。