柠檬酸的生产方式比较灵活，水果提取、化学合成、微生物发酵等都可有效生产，但微生物发酵是经济、安全的方式。在菌选择上也比较宽泛，黑曲霉、棒曲霉、文氏曲霉、芬曲霉、丁烯二酸曲霉、橘青霉、解脂假丝酵母等众多菌都可采用，且对原料没有特殊依赖性，只要能通过微生物代谢产生柠檬酸即可，故柠檬酸的价格非常低廉，这也是其广泛应用的重要基础。

提味，柠檬酸本身是果汁的天然成分之一，在饮料中添加可以赋予产品水果风味，同时使酸度更醇厚，不会出现突兀的感觉；护色，柠檬酸能够控制酚酶的活性，***果蔬原料产生的酶促褐变反应，同时，其具有的防氧化增效效果，能提高护色剂的作用，起到双重护色作用；抑菌，柠檬酸能够有效调节pH，是通过调节环境体系起到抑菌防腐的作用。在***的抑菌实验中，柠檬酸对多种***的抑菌效果还要优于防腐剂山梨酸钾。

当表层土壤中的盐分含量太高或者超过作物能承受的极限时，生长受阻，土壤盐渍化的危害就表现出来了。柠檬酸在盐碱化土壤上能够与土壤表面金属离子络合，能够有效降低离子浓度及其活性，是一种有效的络合。柠檬酸能够清洗滴管，喷灌系统，是一种优良的螯合剂。喷灌，滴灌系统长期使用内壁会产生沉淀，沉淀日积月累会堵塞滴孔，影响施肥效果。柠檬酸能够溶解滴灌壁内的沉淀物质，起到清洗滴灌的***。有效防止滴管堵塞。