基于柠檬酸对钙的代谢可产生的影响，经常食用罐头、饮料、果酱、酸味糖果的人们，特别是孩子，要注意补钙，多喝生奶、鱼头、鱼骨汤、吃些小虾皮等，以免导致血钙不足而影响健康、胃酸过多的患者不宜经常食用柠檬酸。柠檬酸不能加在纯奶里， 否则会引起纯奶凝固。乳制品行业常把柠檬酸配成10%左右的溶液加入低浓度的牛奶溶液中，加入时应快速的搅拌。

当表层土壤中的盐分含量太高或者超过作物能承受的极限时，生长受阻，土壤盐渍化的危害就表现出来了。柠檬酸在盐碱化土壤上能够与土壤表面金属离子络合，能够有效降低离子浓度及其活性，是一种有效的络合。柠檬酸能够清洗滴管，喷灌系统，是一种优良的螯合剂。喷灌，滴灌系统长期使用内壁会产生沉淀，沉淀日积月累会堵塞滴孔，影响施肥效果。柠檬酸能够溶解滴灌壁内的沉淀物质，起到清洗滴灌的***。有效防止滴管堵塞。

正规的柠檬酸除垢剂中，使用的柠檬酸一般为食品级的一水柠檬酸。柠檬酸为食品添加剂，本身是可以食用的。因此，使用柠檬酸除垢剂时，其中的柠檬酸不会对人造成危害。若误食太多，多喝水调节即可。WHO没有对柠檬酸规定每日限制摄入剂量。只要摄入量不是特别大，一般没有什么问题。大部分除垢剂都是纯净柠檬酸，有的也会添加一些消菌物质，一般都是可以是用的，无需过分担心。