由于化学合成的制作工艺相对复杂，参与制药的原料多，反应步骤多，溶剂与原辅料未充分反应而进入废水中等众多原因，制药废水中含有苯类有机物、醇、石油类、氨氮等污染物。同时废水具有水量、水质的波动较大、污染物种类较多、色度深、含盐量高、浓度高等特点，废水的水质大多属于难降解、高浓度的有机废水。

       车间排放的清洗废水流入隔油调节池。 由提升泵输送至混凝反应池。 混凝反应池由两格组成，废水为一格或两格，分别为净水剂1和净水剂2。 絮凝反应后的混合液进入斜管沉淀池，沉淀后除去大部分悬浮物。

      在废水处理过程中，沉淀池中产生的污泥经过污泥沉淀斗进行初步浓缩，除去大部分游离水。 污泥减容后，由隔膜泵提升至板框压滤机，脱水干燥形成泥饼。 运输处置。 污泥浓缩池和压滤机的清水返回调节池，重新进入污水处理系统进行处理，避免二次污染。

       生物处理法是向废水中投加微生物以分解有机污染物的一种方法。常用的有活性污泥法和生物膜法两种：

       (1) 活性污泥法:将生活中的废水中的有机污染物在池内经过好氧微生物的降解作用转化为污泥(即气浮渣)的方法叫活性污泥法;

       (2)生物膜法:在曝气池中安装填料作为微生物附着生长载体形成生物膜从而去除废水中有机物的处理方法称为生物膜技术

       针对含不同成分的废水有不同的废水处理方法。一般采用物理处理法、化学处理法、物理化学法、生物处理法等方法，也有人通过研究发现缺氧水解工艺方法可以很好的处理废水，并达到比较理想的效果。缺氧水解工艺方法处理废水是通过化学作用来***好氧微生物的降解，从而使微生物无法存活，从而达到保护环境的目的。利用这一方法，可达到有效处理废水中***物质的目的。通过采用一类生化工艺“水解酸化+缺氧+好氧”联合工艺来处理废水具有抗冲击负荷能力高、污泥不易流失等特点，并且处理过的水完全可达到排放标准的要求，在环境保护方面起到了很大的作用，工艺稳定并得到广泛的应用。