① 藻类的限制

富营养化湖泊的初级生产力通常以浮游植物为主，呈现浊水态。藻类的遮阴效应、营养盐和无机盐的竞争作用会阻碍沉水植物的生长以及在水域中的空间分布。研究发现，在富营养湖泊(氮0.93mg/L；磷0.33 mg/L)，附着藻对沉水植物的遮阴达到86%。当水体中磷浓度大于0.05 mg/L时，藻类大量生长形成水华；藻类释放的有色溶解有机颗粒物(Particulate Organic Matter,POM)增加光散射，导致光衰减(蓝光，波长476~495nm)也随之增加

在发生藻类水华时，可投放、接种浮游甲壳类动物如长溞(Daphnia longispiana)、大型溞(Daphnia magna)和方形网纹溞(Gerzoda daphnia gamaranaura)等进行控制 。

②鱼类的影响

草食性、杂食性鱼类及底层鱼类会对沉水植物造成影响 。由于草食性鱼类食量大,每天摄食沉水植物的量甚至超过鱼自身的重量，当摄食强度超过沉水植物的再生能力时，会导致沉水植物大规模减少甚至消失。而控制草食性鱼类的生长，会促进沉水植物的生长。去除武汉东湖草食性鱼类之后，微齿眼子菜(Potamogeton maackianus)自行***至6 000 g(WW)/m2的生物量。

沉水植物所处水环境的温度变化比较缓慢而且稳定，其不同的代谢过程对温度的反应有所不同，而生长则代表了所有这些过程及反应的综合。从抽条生物量、抽条长度及抽条数目看，黑藻在较高温度(32 ℃)时比穗花狐尾藻和埃格草表现出较大的生长反应。对埃格草而言，顶生生长在夏季停止，当温度达到30℃时植株开始衰亡，秋季时则***生长;当水温降至10℃时，生物量达大。国内外关于温度对菹草生长的影响研究结果不尽一致。有的研究认为范草适宜生长温度为15℃-20 ℃，，30 ℃时净产氧量高。