配置的软件与系统的硬件资源相适应，除系统软件、应用软件外，还配置了在线故障诊断和杀毒软件等。CEMS设计的分析仪器和监测仪表包含了为日常维护人员检修提供的电信号接口，极大地方便了技术人员检修。?指示功能：数据采集与传输系统除了可以指示上述提到的自诊断和报警内容，还可以显示分析仪在校正循环中、校正气瓶低压、过量的校正误差等内容。

具备两套数据库，一套原始存储原始的气站数据，另一套存储按照***相关数据修正规范修正的数据。系统的数据采集控制器能保证存储原始数据，可提供实时监测数据（7天以上），日均值数据、月均值数据和年均值数据，且所有均值数据存储年限均在10年以上。?直接分析原样，尽可能地保持烟气物理和化学特性，样气具有代表性； CEMS可长期无人值守。

取样探头及过滤器可以自动反吹扫和远程控制反吹扫，防止堵塞；分析系统具有自动和远程标气校核功能；分析仪器、采样器、加热器、伴热管加热器具有故障自动报警功能 。系统可设置条件查询和显示历史数据，内容包括数据库内记录的所有污染物排放相关数据、相关烟气参数以及所有状态及告警信息。CEMS可与电厂、电力局、环保局的局域网，可以远程通讯。大屏幕触摸屏工业控制计算机，页面形象，操作简单。

?其它功能：主要分析仪器自诊断、自动控制、自动校准、系统网络化、错误代码指示等功能。数据采集采用PLC，包括模拟信号采集和状态信号收集。在工控机内，根据温度、压力和流速等参数，将烟气浓度换算成标态，并计算出各烟气污染物的总排放量，生成符合客户要求的报表。系统能生成和打印小时（至少45min的有效数据）、日（至少18h的有效数据）、月（至少22d的有效数据）、年报表，报表中包含大值、小值、平均值、参加统计的样本数等。