目前，生物燃料主要被用于替代化石燃油作为运输燃料，如替代燃料乙醇和替代石油基柴油的生物柴油。在化石燃料储量逐步下降、环境保护日益严峻的背景下，生物燃料受到各国***的高度重视。欧盟会积极推进生物燃料发展，制定了2015年生物燃料占运输燃料消费总量8%的目标。美国首席经济学家说，目前燃料乙醇已成为美国玉米用量的第三大产业。美国通过***手段强制在运输燃料中添加生物燃料，具体比例是柴油中添加2%的生物柴油，添加5%的燃料乙醇。

用麻疯树（又名桐油树）可用于生产生物燃料，这些作物可生长在不适于粮食作物生长的荒地、几乎不需施肥，其种子亦不可食用，对粮食生产影响更小。但有科学家认为：有些第三世界***的农民把原本用来生产粮食作物的土地，拿来种植能源作物，其发展有减少粮食生产的***性。在生物柴油的生产过程中，需要进行酯交换反应，而这也要占到所消耗能源的35%。生物质燃料：是指将生物质材料燃烧作为燃料，一般主要是农林废弃物（如秸秆、锯末、甘蔗渣、稻糠等）

生物质成型燃料（Biomas***ouldingFuel，简称'BMF'），生物质能是指利用自然界的植物、粪便以及城乡有机废物转化成的能源。生物质，除去其在地球生态环境中所起的美学价值外，对人类还是便利的经济的可再生能源。若生物质的种植和管理过程中采用不可持续的农业做法（如过度使用化肥可能造成土壤流失或板结），则可进一步造成生物多样性丧失。 生物质通过光合作用将 CO2和水结合形成碳氢化合物(糖)以构件生物质的骨架，并在此过程中将太阳能储存在生物体内结构化合物的化学键中。