原位杂交电话「思特进」
作者:思特进2021/12/1 14:57:57






原位杂交试验

收集斑马鱼的胚胎,在Holfretor水中培养,到达所需要的发育时期时,用蛋白酶去除卵膜,用4%多聚甲醛固定,在4℃保存,二十四小时后用50%甲6醇2%多聚甲醛溶液洗,然后换成甲9醇,在-20C 保存,待用(两天和两天以上的胚胎需要用双氧6水处理,去除色素。或者使用苯锍脲稀溶液培养,可阻断色素的形成)





惰性多聚体可用来促进250个碱基以上的探针的杂交率。对单链探针可增加3倍,而对双链探针、随机剪切或随机引物标记的探针可增加高达100倍。而短探针不需用促进剂,因其复杂度低和分子量小 ,短探针本身的杂交率就高 。***葡聚糖是一种广泛用于较长双链探针杂交的促进剂。这是一种多聚胺,平均分子量为500 000。另一种常见的促进剂是聚乙二醇(PEG),PEG分子量小(6000~8000)、粘度低、价格低廉,但它不能完成取代***葡聚糖。在某些条件下5%~10%***葡聚糖效果较好,若用5%~10%PEG则可产生很高的本底。因此,使用促进剂时有必要优化条件。



总的来说,随探针浓度增加,杂交率也增加。另外,在较窄的范围内,随探针浓度增加,敏***增加。依我们的经验,要获得较满意的敏***,膜杂交中32P标记探针与非放0射性标记探针的用量分别为5~10 ng/ml和25~1000ng/ml,而原位杂交中,无论应用何种标记探针,其用量均为0.5~5.0μg/ml。探针的任何内在物理特性均不影响其使用浓度,但受不同类型标记物的固相支持物的非特异结合特性的影响。



在选用探针时经常会受到可利用探针种类的限制。如在建立DNA文库时,手头没有筛选特定***的克0隆探针,这时就可用寡核苷酸探针来代替。但必须首先纯化该***的编码蛋白,并测定6个以上的末端氨基酸序列,通过反推的核苷酸序列合成一套寡核苷酸探针。如果已有其它动物的同种***克0隆,因为人类和动物间在同一***的核苷酸顺序上存在较高的同源性,因此可利用已鉴定的动物***作探针来筛选人类***克0隆。对于***核苷酸序列背景清楚而无法获得克0隆探针时,可采用PCR方法扩增某段***序列,并克0隆人合适的质粒载体中,即可得到自己的探针。这种方法十分简便,无论***组DNA探针还是cDNA探针都可以容易地获得,而且,可以建立PCR的***检测方法,与探针杂交方法可作对比,可谓一举两得。



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