原位杂交是指将特定标记的已知顺序核酸为探针与细胞或***切片中核酸进行杂交，从而对特定核酸顺序进行精3确定量***的过程。原位杂交可以在细胞标本或***标本上进行。

原位杂交技术(In situ hybridization，ISH)是分子生物学、***化学及细胞学相结合而产生的一门新兴技术，始于20世纪60年代。

原位PCR；原位杂交细胞***和PCR的高灵敏度相结合的技术，在细胞（爬片、甩片或涂片）或***（石蜡、冰冻切片）上直接对靶***片段进行扩增，通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。

原位杂交 (ISH) 是用于***固定***和细胞中特定核酸靶标的强大技术，能够获得与***表达和遗传位点相关的时间和空间信息。 虽然ISH的基本工作流程与印迹杂交近似，即核酸探针被合成、标记、纯化和特异性靶标退火，但其不同之处在于前者可通过可视化显示***内的结果来获得更多信息。 如今有两种基本方法来实现可视化显示原位RNA和DNA靶标，即荧光 (FISH) 和显色 (CISH) 检测。 每种检测方法本身的特点（见下表）使得FISH和CISH适用于截然不同的应用。 虽然两种方法均使用标记的、与样本杂交的靶标特异性探针，但每种方法用于可视化显示样本的仪器不同。 这里我们将强调每种方法的不同之处和各自的优势。

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在条件都得到满足的情况下，杂交的成败就取决于保温时间。时间短了，杂交反应不完成；时间长了也无益，会引起非特异结合增多。一般杂交反应要进行20h左右。1966年Britten和Kohne推荐用Cot =值来计算杂交反应时间。Cot 值实际上是杂交液中单链起始浓度（Co）和 反应时间（t）的乘积。实验表明Cot =100时，杂交反应基本完成。Cot=0，基本上没有杂交。例如在液相杂交中未标记的DNA 400μg/ml（按单股DNA每微克 紫外吸收值为0.024计算，总的吸收值为 9.6），如果反应时间为21h，那么对于未标记的DNA来说，Cot =9.6/21 =100.8,，杂交完成了。对标记DN A（浓度为0.1μg/ml）来说Cot值为0.05，这就充分排除了标记DNA的自我复性。Tm值25℃时杂交***佳，所以首先要根据公式（4）计算杂交体Tm 值。由此式可见，通过调节盐浓度、甲酰胺浓度和杂交温度来控制所需的严格性。