原位杂交是指；分子杂交的一种形式。由未经抽提分离的染色体DNA，在原来位置上被变性成单链后，与探针进行分子杂交。1977年由本顿(W.D.Benton)和戴维斯(R.W.D***is)在原分子杂交基础上发展的一种较新的分子杂交技术。方法是将菌落或噬菌斑转移到硝9酸纤维素滤膜上，使在原位发生溶菌后变性的DNA，同滤膜原位结合，再与有放5射性同位素标记的特定核苷酸“探针”杂交，其结果可用放5射自显影来显示，出现银粒的地方便是待测染色体DNA上与探针互补顺序所在的位置。对快速检测转化群落中的DNA序列或任何一种插入的DNA序列，以及动植物的******工作，都具有广泛应用价值。(见“分子杂交”、“放5射自显影”、“影印培养技术”)

原位杂交中探针的选择

DNA探针、RNA探针和寡核苷酸探针均能通过不同的酶促分子反应进行标记。寡核苷酸探针的长度较短，因此避免了探针内部退火的问题，在杂交时的渗透能力也更好，探针与靶标的接触这是影响原位杂交是否成功的重要因素之一。DNA探针、RNA探针在合成时需要控制探针片段长度，通常300-1000bp左右，能覆盖到较长片段的靶核酸序列，增加检测的灵敏度。

另一种多聚体促进剂是聚丙0烯0酸，用其钠盐，浓度为2%～4%。与***葡聚糖相比，其优点是价格低廉，粘度低（MW=90 000）。小分子化学***酚和Guandine thiocyanate也能促进杂交，它们可能是通过增加水的疏水性和降低双链和单链DNA间的能量差异而发挥作用。酚作为杂交促进剂，只能在低DNA浓度的液相杂交中观察到，该方法曾被称为酚乳化复性技术，该法不能用于固相杂交，因酚可引起核酸与膜的非特异吸附作用，即使在液相杂交中的应用也是有限的。而Guandine thiocyanate可通过降低双链DNA的Tm值而起作用。此外，该分子还可以促进RNA的杂交，有裂解细胞而***RNase的作用。总之，***葡聚糖和聚乙二醇因能用于固相杂交是目前***常用的杂交促进剂。



在选用探针时经常会受到可利用探针种类的限制。如在建立DNA文库时，手头没有筛选特定***的克0隆探针，这时就可用寡核苷酸探针来代替。但必须首先纯化该***的编码蛋白，并测定6个以上的末端氨基酸序列，通过反推的核苷酸序列合成一套寡核苷酸探针。如果已有其它动物的同种***克0隆，因为人类和动物间在同一***的核苷酸顺序上存在较高的同源性，因此可利用已鉴定的动物***作探针来筛选人类***克0隆。对于***核苷酸序列背景清楚而无法获得克0隆探针时，可采用PCR方法扩增某段***序列，并克0隆人合适的质粒载体中，即可得到自己的探针。这种方法十分简便，无论***组DNA探针还是cDNA探针都可以容易地获得，而且，可以建立PCR的***检测方法，与探针杂交方法可作对比，可谓一举两得。