除人工清洗外，船舶还可以通过添加剂逐步清洗HSFO油舱和燃料系统中的沉淀物和沥青质污泥，这种方法相对安全且简单，可以为船舶节省很多时间成本和经济成本。定期清洗船舶燃油舱安全有效的方法是安排船舶进坞彻底检查和清洗，短期内安排***所有正在使用HSFO的船舶进船坞清洗燃油舱并不现实。船舶进入船坞进行燃油舱清洗所需要的时间因船而异，但一般来说每个燃油舱清洗的平均耗时为2-4天，再加之对船舶燃油系统管路的冲洗。

冲洗船舱的灰土、船舱垫尘、油污等产生的废水，该类废水属于含油废水或含有一定毒性液体的污水。进入程序必须遵守国际海事***第A.1050(27)号决议关于《进入船上密闭舱室的建议案》中的安全措施。定期清洗船舶燃油舱安全有效的方法是安排船舶进坞彻底检查和清洗，短期内安排***所有正在使用HSFO的船舶进船坞清洗燃油舱并不现实。

由于清洗油舱所以污水含有色度，所以洗舱污水在处理时就需要用到水处理药剂-脱色剂。在2020年1月1日之前，***大部分使用HSFO的船队都不可能在很短的时间内进行干船坞检查、清洁。油舱在清洗之前需要排空，这段时间也应计算在内，且冲洗船上燃油系统管路还需要1-2天。油舱清洗后的残余物应通过正确方式排放或由港口接收设施处理。