铁在硅石中常以以下几种形式存在以微细粒状态赋存在粘土 或者高岭土化的长石中;以氧化铁薄膜形式附着在石英颗粒的外表;含在重矿物和铁矿物等颗粒中;石英颗粒内部呈浸染或透镜状态或以固溶态存在于石英晶体内部。此外，加工过程中也会混入一定量的机械铁。

含铝杂质主要来自长石、云母和4689289323粘土矿物 还有Al3+替代 Si4+存在于石英晶格中。这种异价类质同象的替换，常造成碱金属阳离子进入结构空隙，以保持电子的平衡，形成结构杂质。

此外 硅石中普遍存有流体包裹体 按其成因可分原生包裹体、假次生包裹体、次生包裹体三类 原生包裹体是先于主矿物或与主矿物同时形成的包裹体 其特点是包裹体生成后不发生空间上的移动。原生包裹体占据主矿物结晶构造位置上 均匀分布于晶体中。

假次生包裹体是主矿物结晶过程中 由于应力和构造作用 使已结晶的矿物发生破碎和裂开 这些裂隙中 成矿溶液又重新进入而发生重结晶时形成的包裹体。其特点是形成之后在空间上发生过位移。假次生包裹体外端终止于晶体内的一个生长面 并存在着明显的排列面。

次生包裹体是形成于主矿物结晶基本完成之后任何过程的包裹体 晶体形成后 因受外界作用力的影响而*** 发生裂隙 这时在环境中活动的含矿溶液就有可能渗入晶体内成为包裹体。次生包裹体一般在后期构造愈合的位置上 常沿裂隙分布 且几组包裹体可以相交 形状较为复杂。