有机肥，是有机物制作的肥料，而化肥是靠人工合成的无机物。常用的自然肥料品种有绿肥、人粪尿、厩肥、堆肥、沤肥、沼气肥和废弃物肥料等。化肥与有机肥的性质有很大的不同。化肥料含有的营养元素的种类单一或较少，但养分含量高，肥效迅速（个别除外），但肥效猛而不长，改善土壤作用不太大，甚至有***土壤的***；而有机肥料养分种类多或较全，肥效慢但肥效昌，有改良土壤性质的作用。

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堆肥有机肥料作物茎秆、绿肥、杂草等植物性物质与泥土、人粪尿、垃圾等混合堆置，经好气微生物分解而成的肥料。多作基肥，施用量大，可提供营养元素和改良土壤性状，尤其对改良砂土、粘土和盐渍土有较好效果。

单施氮素化肥，或单施低量有机肥，或低量有机肥与氮素化肥配合的处理，土壤中的磷都是亏缺的。这类肥料一般含有机质和腐殖酸，氮的含量相对比磷钾要高，能够改良土壤，培肥地力，增强作物抗旱能力以及刺激作物生长发育。前者比后者亏缺更多。只有施用高量有机肥，和高量有机肥与化肥配合的处理，土壤中的磷才有盈余。与土壤磷素变化相同，各处理9年平均土壤效钾含量与对照比较，单施氮肥处理几乎与对照没有什么差别，单施低量有机肥和低量有机肥配合施用氮肥的处理，效钾增加6～7毫克/公斤，施用高量有机肥和配合施用氮肥的处理，效钾增加11毫克/公斤。可见施用有机肥对土壤磷、钾素平衡十分重要。中国化肥生产中氮磷钾比例失调，中国耕地有近3亿亩缺钾，10亿亩缺磷。