农村生产生物有机肥一般利用农业废弃物经微生物发酵，制得含多种微生物的有机肥。农业废弃物主要是畜禽粪便和秸秆。在水资源丰富的地方，养殖场常使用水冲的方法清理畜禽粪便。有自来水的接上自来水冲洗粪便，没有自来水的在池塘边装上水泵冲洗粪便。冲洗岀来的水大量流入河塘污染环境。有的将粪便收集起来存放在土池中任其沤制，臭气冲天，聚集运至有机肥料厂做原料。使用水冲粪做原料一定亏本。

生物有机肥是在堆肥的基础上， 向腐熟物料中添加功能性微生物菌剂进行二次发酵而制成的含有大量功能性微生物的有机肥料。它与其他肥料相比具有培肥土壤、改善产品品质等优势。

与化肥相比，生物有机肥的营养元素更为齐全， 长期使用可有效改良土壤，调控土壤及根际微生态平衡，提高作物抗病虫能力，提高产品质量。

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传统的化肥相比，生物有机肥很好的处理了土壤问题，可以改进土壤和进步作物质量。生物有机肥含有丰厚的有机质和各种营养物质，不只为植物生长提供营养，其丰厚的微生物，还可促进土壌团粒构造构成，改进主壤物理性状，进步主壤保肥保水才能，是处理土壤问题的不二之选。微生物在生物有机肥中发挥宏大作用，那么，生物有机肥中的作为生物到底是些什么生物呢？

生物有机肥设备所产产品是以鲜鸡、猪粪为原料，不含任何化学成份，而鸡、猪消化能力差，只能消耗掉25%的营养成份，而饲料中另外75%营养成分随粪便排出，从而使干成品含氮、磷、钾、有机质、氨基酸、蛋白质等成份。对堆肥产生的恶臭需加以防治与控制，避免二次污染。在堆料中加入发酵剂或快速分解菌可在较短时间内消减臭气，且感官效果较好;或者对堆肥场产生的恶臭气体以生物除臭技术等进行处理。