选择气相色谱仪毛细管柱时，***重要的是选择***佳固定相。这也是***难以确定的。***可靠的方法是参考色谱柱制造商和供应商、气相色谱仪制造商以及出版的文献中所提供应用实例汇编。尽管可能无法参考完全相同的应用实例，但是通常可以得到足够信心来简化决策或减少尝试的色谱柱数量。***困难的情况是没有可供使用的先例。即使仅有一张色谱图包括了样品的所有和大部分化合物，那么固定相选择要容易的多。

固定相选择性和极性的概念在选择固定相时非常有用。选择性决定于溶质和固定相分子的物理化学相互作用力，极性决定于固定相的结构。极性确实对分离有影响，但这仅是影响峰分离的众多固定相性质之一。选择性可以认为是固定相在区分两种溶质分子化学或物理性质方面差异的能力。如果固定相和溶质间的相互作用力不同，则可分离。对于液体或胶态固定相3种相互作用：色散、偶极、氢键作用力。

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