明清祠堂建筑的区别主要体现在：

第1，从体量上看，明式比较偏矮偏小，清式偏高偏大。

其第二，从屋面上看，明代建筑比较舒缓，有明显的弧度，清代建筑则比较陡直。屋面有弧度的做法叫"提栈"又称"举折"始于宋代，明代比较普遍。

第三，从柱础上看，明代多用木鼓礅，少用青石鼓礅。青石鼓礅一般带都有雕刻，内容多见花卉，线条简洁流畅，手法饱满圆润。俗称"青石价沿木鼓礅"就是典型的明代做法。清代多用石鼓礅，材质大多为花岗石，以素面为主，少雕刻。

第1，从梁架上看，明代一般不用山雾云，要用也比较简洁。清代则多用山雾云，并且大而繁。

第2，从墙体砌筑方法上看，明代一般为实砌，且多用叠涩砌法。梢间山墙内侧，一般贴有砖细墙裙。清代有实砌，有空斗，也有下实上空混合砌法，但未见有叠涩砌筑的做法，也很少使用砖细墙裙。

第3，从梁枋、门窗雕刻风格上看，明代简洁流畅，饱满圆润，富有动感。清代繁琐，程式化，缺乏生气。灰塑水作的风格与木作基本一致。

祠堂建筑的"三雕"即木雕、砖雕、石雕，有负载传达信息的任务，有劝谕、认知、教化的作用。明清两代的"三雕"达到了"图必有意，意必吉祥"的程度。如"闻鸡起舞""樵夫晚归"是教育人们勤劳奋发；"寒窗苦读""状元游街"反映的是读书做官：梅花寓意傲霜斗雪、松树寓意坚强不屈；竹枝与花瓶组合为"竹报平安"；两只柿子与一只如意相配为"事事如意"等等。