粪便污水由沼气净化池处理，取消了化粪池，所产生的沼气供公厕管理人员作生活燃料，废液作为厕所屋顶、墙面、周围环境绿化及种菜的有机肥料，具有粪便处理效果好、综合利用废料、使用方便、环境优美、经济效益、环境效益和社会效益显著等优点。

国内近年来开始研究的将传统的化粪池改造为五格厌氧消化池，是一个应用前景广阔的发展方向。国外目前多采用小型厌氧或好氧污水净化槽，亦值得研究。

化粪池中连接有两个管道（用于进和出）。进水管将化粪池中的废水收集起来，时间足够长的话，固体和液体废物就会相互分离。出口管也称为排水区，从化粪池中移出预处理后的废水，均匀地分配到土壤和水道中。需要抽空化粪池的频率取决于家庭的人口的多少、产生的废水量、废水中的固体体积以及化粪池的大小。比如一个四口之家，抽空化粪池一般的经验是每三年一次。

化粪池为农业生产提供肥料的作用已基本消失，但在广大农村，化粪池对改善居住环境仍十分重要。临时性储存污泥，有机污泥进行厌氧腐化，熟化的有机污泥可作为农用肥料。在化粪池厌氧腐化的工况环境中，杀灭蚊蝇虫卵。户用化粪池可作为村镇级污水处理厂的预处理系统。生活污水的预处理（一级处理），沉淀杂质，并使大分子有机物水解，成为酸、醇等小分子有机物。