屋顶绿化植物的根系若不采用阻拦的措施，会对屋顶的结构造成一定的伤害。即使是在仅有防水层或包括压制层的屋面上，由于空气的流动作用导致一些植物的种子飘落屋面上，在一定的条件下，植物也能顽强的生长。其后果导致其根系穿透防水层，甚至结构层，从而使整个屋面系统失去作用。在花园无卖弄上，由于涂层的存在，产生了更有利于植物生长的环境。其他的某些外来植物一般都较我们预先铺设的植物更具生命力，这些植物会不断侵蚀其他植物的领地。另外，草类植物的根系相当发达并且穿透力较强，对防水层及结构层的***力也很大。所以在建筑物的结构层上进行园林建设时，就必须引导和限制植物根系的生长。保护作用：屋顶绿化可对建筑物的顶部具有保护作用，防止热胀冷缩引起的楼板破1裂，防止酸雨对建筑物的侵蚀，减少建筑物风化危害。否则，植物根穿透防水层会造成防水功能失效；植物根穿透结构层而造成更为严重的结构破。