洁净室的分类：按气流流型洁净室可划分为：单向流洁净室；非单向流洁净室；混合流洁净室；矢流洁净室。单向流洁净室：单向流（层流）洁净室，其中又分垂直单向流洁净室和水平单向流洁净室。按洁净室主要控制对象划分洁净室又可划分为：工业洁净室；生物洁净室。工业洁净室：工业洁净室主要的控制对象是灰尘粒子（不分有生命的、无生命的）。工业洁净室主要应用在电子、航天、航空、机械、化工、化学制药、能源、纳米等工业中。尤其是电子工业和光电子工业更是离不开洁净室和洁净技术。

洁净室的净化空调负荷由下面几部分组成：室内负荷，主要包括：室内作业人员的散热、散湿负荷。室内照明灯具的散热负荷。洁净室围护结构（墙、顶、地、门、窗）的传热、传湿负荷。生产设备和生产过程的散热、散湿负荷。洁净室新风处理的热、湿负荷。夏季是降温去湿；冬季是加热、加湿。空气循环时风机（或FFU）的温升和水泵的温升负荷。

生物洁净室，以控制有生命微粒（***）与无生命微粒（尘埃）对工作对象的污染。又可分为：一般生物洁净室，主要控制微生物（***）对象的污染。同时其内部材料要能经受各种灭菌剂侵蚀，内部一般保持正压。实质上其内部材料要能经受各种灭菌处理的工业洁净室。生物学安全洁净室：主要控制工作对象的有生命微粒对外界和人的污染。内部要保持与大气的负压。