由于发酵罐功能的强大，其主要应用于三个领域：食物工业、工业、环境科学。在食物工业上，发酵罐常用于三大类商品，一是出产传统的发酵商品，如啤酒、果酒、食醋等;二是出产食物添加剂;三是协助解决粮食疑问。

　　在药工业上，根据发酵工程技能，开发了品种繁复的***，如人类、重组***苗、某些品种的单***、白细胞介素-2、抗血友病因子等。在环境科学上，主要应用于污水处理中微生物的强化。微生物发酵的兴起带动发酵罐需求的增加，在科技的前进中发酵罐的效果在不断改变，不仅提高了安全性，也逐渐深入到人们的日常生活中。

现在，一些红葡萄酒也会在橡木桶中进行发酵，不过在发酵时需要去掉桶盖以便手动压帽。这个过程比较耗费人力，因其成本相当昂贵，所以只适用于生产少量的葡萄酒。旧世界的产酒国，其白葡萄酒桶中发酵法（主要是霞多丽）有着非常悠久的历史，近年来这种方法也被其他地方所采用。在这里，葡萄压榨的汁液会被立即送到橡木桶中，加入酵母后进行酒精发酵，并且会在酵母***后定期搅拌酒脚(lees)，为葡萄酒添加口感材质和风味特征。

在沼气发酵过程中，不产***菌和产***菌之间，相互依赖，互为对方创造与维持生命活动所需要的良好环境条件，但它们之间又互相制约，在发酵过程中总处于平衡状态。它们之间的主要关系表现下列几方面：

提供基质

①不产***菌为产***菌提供生长和产***所需要的基质

不产***菌可把各种复杂的有机物，如碳水化合物、脂肪、蛋白质等厌氧分解生成H2、CO2、NH3、VFA、***、丙酸、丁酸等，丙酸、丁酸还可被氢菌和***菌分解转化成H2、CO2和***，为***菌提供了合成细胞质和形成***的碳前体，电子供体——氢供体和氮源，使***菌利用这些物质***终形成***。