柔性版印刷使用液体油墨，不需要复杂的输墨系统，只需一只墨斗辊将油墨传递给网纹棍或将网纹棍直接同油墨接触(凹印输墨方式)，网纹棍表面的油墨然后被刮墨刀去掉、油墨保存在网穴里，这种传墨方式称为短墨路系统。短墨路系统机构简单、调整方便、材料消耗低，是柔版印刷的显著特点。

而凸版印刷为使膏状油墨均匀地转移到印版上，凸版印刷机上有复杂的输墨系统，包括;墨斗、墨斗辊、传墨辊、传墨辊、串墨辊、着墨辊等，称为长墨路系统。只有通过长墨路系统，膏状油墨才能形成均匀的墨层。

柔性版印刷使用的油墨，是类似于凹版印刷的低粘度油墨。要根据产品的质量要求来选择不同连结料和溶剂的油墨进行印刷。例如，怎么才能印得好，为了得到具有良好耐热性能和韧性印迹的印刷品，可以选用由醇类树酯为连结料的油墨；希望印刷品有良好的光泽，可选用以聚胺酯体系树脂为连结料的油墨。又如，在聚乙烯类非吸收性薄膜上印刷，可选择快干性、附着性好的乙醇溶剂墨；若在瓦楞纸，书、报类纸张上印刷，可选择易清洗 、无环境污染的水性油墨。

柔版印刷在印刷彩色的网线印刷品时，为了得到适当的墨量，网线辊的网线密度必须和柔性版的网点线数相匹配。实践表明，网纹辊的网穴密度是柔性版网点线数的3～4倍为好。如，使用150线/in（60线/cm）的柔性版，包装箱怎么才能印得好，应选用600线/in的网纹辊，如果用360线/in的网纹辊，则因供墨量过大，从而发生“糊版”的故障。