制版中洗版液不同：凸版印版和柔性版印版的厚度、树脂成分和配方不同所以洗版液的种类也不一样。凸版洗版液是以蒸馏水为清洗介质，而柔性版的洗版介质是特殊配方的溶剂(近年来，编织袋柔性印刷版制版，市场上又出现了水可洗柔性版材料，但未普及应用)。两种印版使用的介质不同，干燥时间也不一样，通常凸版印版烘干时间为几分钟到十几分钟，而柔性版印版的烘干时间是从一小时到十几小时。

柔性版印刷中因为柔性版印刷的压力很小，压力稍有变化都会对印刷质量产生明显变化，压印力的控制变得非常重要。柔性版印刷需重新设定分色参数，不能照搬胶印或凹印。我国引进的大多是机组式的柔印设备，机组一般有6-8个，再加上包装行业较多采用专色，因此，纸箱柔性印刷版制版，柔印在分色上要考虑多色分色，以弥补印刷上网点表现的不足。而且需要设计合理的后工序来配合。

柔性版印刷要根据原稿和客户要求，选定合适的印刷色数、色序、幅面及相应的版辊（齿数、网线数等）。

柔性版印刷的原稿有许多是由胶印转过来的，柔性印刷版制版，这两种印刷工艺之间有着很大的区别，因此不能够照抄照搬胶印的工艺（尤其是分色制版工艺），要根据柔性版印刷工艺自身的特点，结合该公司柔版印刷机的性能来处理原稿，并同客户协调好。

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