运行成本及经济承受能力是方案选择的重要因素之一。总体来说,焚烧的成本***1高(是其它工艺的2~4倍),而其它方案的综合成本差异不显著。堆肥化若采用静态条垛工艺,则成本***1低,但其生产周期长,占用土地多,且对周围环境的影响比较严重;若采用发酵仓,则设备***和运行费用将增加,而且若要制成复合肥还需烘干造粒设备,这样其成本优势就大大削弱了。如厌氧和好氧消化除了降解有机物外，还可以大大减少病原体的数量。因此,考察污泥利用的成本时,应在统一产品质量标准和环境影响标准的基础上,从设备***、运行费用、地价、人力价格等多方面进行综合评估。

污泥处理设施的选址是方案选择的决定因素之一。一般而言,污泥宜就近处理,以节省运输费用和减少湿污泥运输对沿途造成的污染。由于污泥处理过程中可能会带来臭味、******气体及病原体等环境问题,所以选址会对方案选择产生决定性影响。虽然生活污水中的剩余污泥存在着很多***的物质，但同时其中也含有丰富的钾、磷、氮等元素，这些元素对于植物的生长有很好的作用，可以对土壤结构进行改善，利于实现物质和能量的循环利用。如果污水处理厂远离城区并有闲置土地,则堆肥不失为一种合理选择。在生产用地紧张的情况下,热干化显得较有优势,它不仅占地面积很小,而且可以满足严格的环保标准(其尾气经严格除尘除臭后才排放,厂房内的气体也进行除臭处理),即使在德国、瑞士等地也有污泥热干化厂建在市区或旅游区内的情形。

针对污泥直接焚烧和混合焚烧时的问题，国内外学者提出了污泥合成燃料技术。污泥合成燃料技术主要是污泥与其他高热值的燃料( 如煤、木屑、农作物秸秆等) 在添加少量固硫剂、防腐剂、粘结剂的条件下进行混合成型，制备成型燃料的过程。污泥是一种高灰分、高挥发分、低固定碳含量、低热值的燃料，具有着火容易、着火温度低、着火方式为均相着火、燃烧物质以挥发分为主等燃烧特性。而高挥发分燃料燃烧时，挥发分析出速度快，燃烧平稳性差。污泥合成燃料技术可以明显改善污泥的燃烧特性，使污泥中的挥发分缓慢释放，且燃烧过程能够保持骨架结构，燃烧更加充分，二次污染物减少。中1国科学院地理科学与资源研究所曾做过一个调查，在***各省（市、自治区）选取了140个城市污水处理厂做持续测试，结果显示***含量超标率非常低。合成燃料可以显著降低污泥体积，减少运输储存成本，而且产品无臭味，储存过程不存在二次污染和粉尘爆1炸的***，具有良好的经济效益。