外显子测序外显子组测序（exome-seq）是对定向富集的***组DNA进行高通量测序，它能够以相对低的费用对人类外显子组进行拷问。2009年，外显子组捕获工具的出现，让外显子组测序这种技术迅速红起来。到目前为止，已有超过1万个外显子组被测序。如今有多家公司推出了外显子组捕获***，包括罗氏NimbleGen、安捷伦、Illumina，还有现在的华大***。这些方法究竟孰优孰劣，南京分子生物，斯坦福大学***院遗传学系的研究人员对市场上三个主流的外显子组测序平台进行了比较。该研究结果发表在《NatureBiotechnology》上。研究人员利用安捷伦、Illumina和NimbleGen的外显子组测序平台对同一个人类血液样品进行分析。他们的结果表明，NimbleGen平台作为一个使用高密度重叠探针的平台，尽管覆盖了较少的***组区域，但在灵敏检测小的变异时所需的测序量也少。在同样获得80M测序数据的情况下，NimbleGen有97%的目标序列达到10x以上的测序深度，而其他产品只有90%。而安捷伦和Illumina的探针能够在低密度下捕获更多数量的变异。此外，Illumina还捕获了未翻译的区域，这是NimbleGen和安捷伦平台无法靶定的。研究人员还比较了同一样品的外显子组测序和全***组测序（WGS），显示外显子组测序能够检测到WGS错过的小变异。除了文中提到了三个主流平台，外显子组捕获方面的新产品也在不断推出，研究人员的选择也将更广泛。罗氏NimbleGen即将推出新一代的外显子液相捕获产品。这一新产品将可捕获64M的***组序列，包括外显子以及miRNA，它含与其他NimbleGen液相捕获产品相同的2.1M高密度探针，分子生物学，以高xiao、均一、特异、的定向捕获。分子实验介绍——荧光定量PCR检测荧光定量PCR是检测生物样品中RNA含量的普遍的方法，通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针，对PCR产物进行标记跟踪，实时在线监控反应过程，结合相应的软件可以对产物进行分析，计算待测样品模板的初始浓度。目前主要使用Sybrgreen和taqman法对RNA含量进行检测。Sybrgreen在低样本量时成本较低，目前选用的较多。SYBRGreenI是一种只与DNA双链结合的荧光染料。当它与DNA双链结合时，分子生物服务，发出荧光；从DNA双链上释放出来时，荧光信号急剧减弱。因此，在一个体系内，其信号强度代表了双链DNA分子的数量。SYBRGreen荧光染料法定量PCR的基本过程是：1、开始反应，当SYBRGreen染料与DNA双链结合时发出荧光。2、DNA变性时，SYBRGreen染料释放出来，荧光急剧减少。3、在聚合延伸过程中，引物退火并形成PCR产物。4、聚合完成后，SYBRGreen染料与双链产物结合，定量PCR系统检测到荧光的净增量加大。实验流程：细胞或***RNA提取-RNA浓度检测-RNA逆转录-定量PCR检测。结果示例：图A***扩增曲线图；B***扩增溶解曲线图；CmRNA相对表达量变化从图中可以扩增曲线可以看出目的RNA扩增效果，溶解曲线可以看出引物识别特异性情况，通过使用ΔΔCt方法计算可以得到每个组中目的mRNA表达变化。LncRNA芯片Longnon-codingRNAs（lncRNAs）是一类转录本长度超过200nt的功能性非编码RNA分子。目前的研究已证实，lncRNA参与X染色体沉默，***组印记以及染色质修饰，转录ji活，转录干扰，核内运输等多种重要调控过程。随着对lncRNA在哺乳动物进化及人类***发生和发展中作用的日益关注，lncRNA调控机制已成为当前遗传学研究的热点问题。筛选出差异表达的lncRNA是研究其在人类***发生中所扮演角色的基础。富衡生物为用户提供高通量的lncRNA芯片进行lncRNA表达谱分析，该芯片基于Agilent的SurePrint技术生产，实验稳定可靠。技术优势信息覆盖广泛：覆盖了多个quan威lncRNA数据库发布的数据；提供人，小鼠，大鼠的lncRNA检测。lncRNA和mRNA同时检测：芯片上包含有的lncRNA和新的mRNA序列检测探针。一次芯片实验可同时对lncRNA和mRNA进行分析。平台成熟可靠：采用Agilent原位喷墨合成技术，了高检测灵敏度和特异性。数据分析：提供lncRNA和mRNA表达谱差异分析和功能分析，以及二者的关联分析。分子生物服务-南京分子生物-英瀚斯(查看)由南京英瀚斯生物科技有限公司提供。南京英瀚斯生物科技有限公司（www.enhancer-/）是江苏南京,技术合作的企业，多年来，公司贯彻执行科学管理、创新发展、诚实守信的方针，满足客户需求。在英瀚斯***携全体员工热情欢迎各界人士垂询洽谈，共创英瀚斯更加美好的未来。)